Компьютерная химия, также известная как математическая химия, представляет собой сравнительно новую область химической науки, которая активно использует разные вычислительные методы и конечно дискретную математику, в частности теорию графов и комбинаторику, для решения задач как фундаментального, так и прикладного характера. Учитывая общепринятое определение химии как науки о веществах и их превращениях, в компьютерной химии молекулы представляются в виде молекулярных графов, а химические реакции – в виде формальных операций с этими графами. Такой подход существенно упрощает алгоритмизацию химических задач, сводя их к стандартным задачам комбинаторики и дискретной математики, что позволяет находить решения с помощью компьютерных программ.
